สืบเนื่องจากในปีงบประมาณ พ.ศ.2545 ได้มีการรวมกลุ่มของผู้อำนวยการกองแผนงาน มหาวิทยาลัยของรัฐบางส่วน ได้แก่ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย มหาวิทยาลัยมหิดล มหาวิทยาลัยสุโขทัยธรรมาธิราช มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์ มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระเจ้าเกล้าธนบุรี สถาบันเทคโนโลยีพระเจ้าเกล้าพระนครเหนือ สถาบันเทคโนโลยีพระจอมเกล้าเจ้าคุณทหารลาดกระบัง และมหาวิทยาลัยแม่โจ้ เพื่อประชุมหารือในการปฏิบัติงานร่วมกันระหว่างมหาวิทยาลัย รวมทั้งแลกเปลี่ยนความรู้ในการปฏิบัติงานด้านนโยบายและแผน โดยได้กำหนดให้มีการประชุมหารือร่วมกันทุก 2 เดือน และได้จัดประชุมสัมมนาผู้อำนวยการกองแผนงานสถาบันอุดมศึกษาของรัฐ ตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา โดยให้แต่ละมหาวิทยาลัยร่วมเป็นเจ้าภาพการจัดประชุมเครือข่ายและการจัดสัมมนาประจำปี

อนึ่ง ในการประชุมผู้อำนวยกองแผนงานสถาบันอุดมศึกษาของรัฐ ครั้งที่ 7/2550 เมื่อวันที่ 18 สิงหาคม 2550 ณ จังหวัดเชียงใหม่ ที่ประชุมได้คัดเลือกผู้อำนวยการกองแผนงาน มหาวิทยาลัยแม่โจ้เป็นประธานเครือข่าย และมีมติให้จัดตั้งที่ประชุมเครือข่ายผู้อำนวยการกองแผนงานสถาบันอุดมศึกษาของรัฐ